La structure est compliquée par plusieurs failles faisant partie du système des failles bordières du fossé de la Saône.

Le village est passé de 365 habitants en 1790 à 151 en 1968. On en compte environ 200 actuellement, en 2023.

Il y a eu, lors de la guerre mondiale de 14-18, 7 morts habitant à Villers-sur-Port.

La seigneurerie de Franois appartenait, en 1431, à Renaud d’Avanne, puis ensuite aux seigneurs de Villers. Vallerois appartenait à une famille du même nom dont était issu Jehan de Valeroy inhumé dans l’abbatiale de Faverney le 19 avril 1935.

L’église est sous le titre de Saint Urbain, pape. Elle a été reconstruite au 18^e siècle. Au début du 14^e siècle, c’était le curé d’Authoison qui y faisait les offices. Elle possède deux cloches, dont l’une date de 1631, et l’autre de 1847. Dans cette église se trouve une toile représentant l’Annonciation et la Trinité, datant du 18^e siècle.

Dans le village se trouvait au siècle dernier une statue de la Sainte-Trinité, reproduite par Louis Suchaux dans son dictionnaire. Elle a disparu depuis.